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AWS HealthOmics añade alternativas de aceleradores para Nextflow

AWS HealthOmics ahora permite que los flujos de trabajo de Nextflow definan una lista priorizada de GPU, FPGA o CPU y cambien automáticamente si los recursos no están disponibles.

BrevePor Publicado por Oossa: 1 min de lectura

AWS HealthOmics ha añadido una directiva de alternativa de recursos para los flujos de trabajo de Nextflow. Los usuarios pueden enumerar sus tipos de aceleradores preferidos —como GPU o FPGA— y una alternativa de CPU. Si la primera opción no está disponible, el servicio pasa a la siguiente sin que sea necesario volver a enviar el trabajo. Se pueden configurar los tiempos de espera de cada opción, lo que permite equilibrar la rapidez con la posibilidad de obtener el hardware preferido. La función ya está disponible en todas las regiones de HealthOmics, incluidas US East, US West, Europa, Israel y APAC.

Por qué importa

Los equipos de bioinformática pueden mantener sus flujos de trabajo en marcha sin reiniciarlos manualmente, lo que agiliza el análisis de datos en la investigación sanitaria.

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