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AWS HealthOmics adiciona fallback de aceleradores no Nextflow

O AWS HealthOmics agora permite definir uma lista prioritária de GPUs, FPGAs ou CPUs para fluxos de trabalho do Nextflow, com troca automática quando os recursos não estão disponíveis.

NotaPor Publicado pelo Oossa: 1 min de leitura

O AWS HealthOmics adicionou uma diretiva de fallback de recursos para fluxos de trabalho do Nextflow. Os usuários podem listar os tipos de aceleradores preferidos — como GPUs ou FPGAs — e uma alternativa de CPU. Se a primeira opção não estiver disponível, o serviço passa para a próxima sem que seja necessário reenviar o trabalho. Os tempos limite de cada opção podem ser configurados, permitindo equilibrar a rapidez com a chance de obter o hardware preferido. O recurso está disponível em todas as regiões do HealthOmics, incluindo US East, US West, Europa, Israel e APAC.

Por que importa

As equipes de bioinformática podem manter os pipelines em execução sem reinicializações manuais, acelerando a análise de dados em pesquisas na área da saúde.

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