Forskare vid University of Washington, under ledning av David Baker, använde AI-baserade designverktyg för att konstruera nya proteaser som klyver utvalda proteinsekvenser. De utgick från ett zinkproteas och ett cysteinproteas och designade om resten av varje enzym med RFdiffusion2 och ProteinMPNN. Efter att ha testat dussintals varianter såg de att vissa konstruktioner kunde klyva målproteiner i celler, däribland proteiner kopplade till Alzheimers sjukdom och frontotemporal demens. De bästa varianterna var upp till 10 gånger mer aktiva än de ursprungliga konstruktionerna.
Varför det spelar roll
Om de vidareutvecklas kan sådana AI-designade enzymer bli verktyg för att behandla sjukdomar som orsakas av felveckade proteiner.