Google DeepMind presenteerde AlphaGenome 2 op 11 Nov 2026. Het model voorspelt hoe veranderingen in DNA de genactiviteit in specifieke celtypen en -toestanden beïnvloeden. Eerdere hulpmiddelen konden dat alleen op weefselniveau. Onderzoekers kunnen nu voor een bepaalde variant nagaan wat er gebeurt in een hartspiercel tegenover een immuuncel in de darm. Het bedrijf stelt het model vandaag beschikbaar voor niet-commercieel onderzoek via de AlphaGenome API. Voor commerciële projecten is er een besloten preview.
Waarom voorspellingen op celniveau belangrijk zijn
Elke cel in het lichaam bevat hetzelfde DNA, maar in elke cel staan andere genen aan of uit. Een variant die onschadelijk is in huidcellen, kan in hersencellen een gen verstoren en zo ziekte veroorzaken. Door rekening te houden met de identiteit van een cel kan AlphaGenome 2 zulke effecten opsporen die modellen voor hele weefsels missen. Žiga Avsec, hoofd genomica bij DeepMind, zegt dat dit detailniveau cruciaal is voor de ontwikkeling van geneesmiddelen, die zich richten op eiwitten in specifieke celtypen.
Hoe AlphaGenome 2 beter is dan zijn voorganger
AlphaGenome 1 gebruikte een parallelle architectuur die zijn capaciteit over veel weefsels tegelijk verdeelde, waardoor het model minder gevoelig was voor subtiele verschillen tussen celtypen. AlphaGenome 2 heeft een nieuw, conditioneel ontwerp: in elke laag krijgt het model een DNA-sequentie en een specifieke celtoestand als invoer. Het nieuwe model is getraind op meer dan 100 miljoen profielen van individuele cellen uit 68 weefsels en vindt bijna twee keer zoveel varianten die de genexpressie veranderen als AlphaGenome 1. Het kan ook effecten voorspellen voor celtoestanden die het nog niet eerder heeft gezien, zoals immuuncellen die door een vaccin zijn geactiveerd, zonder dat het opnieuw hoeft te worden getraind.
Waarom het ertoe doet
Voor biomedische onderzoekers biedt AlphaGenome 2 een manier om ziektegeassocieerde DNA-varianten rechtstreeks te koppelen aan de celtypen die symptomen veroorzaken, wat het vinden van aangrijpingspunten mogelijk kan versnellen. Geneesmiddelenontwikkelaars kunnen het model gebruiken om te bepalen welke varianten in een specifiek weefsel prioriteit verdienen, zodat preklinisch onderzoek gerichter wordt. Dankzij de commerciële preview kunnen biotechbedrijven het hulpmiddel alvast testen. Door de hogere rekenkosten zal het goedkopere AlphaGenome 1 echter niet worden vervangen voor brede analyses.
