Google DeepMind推出AlphaGenome 2，可预测DNA变异对特定细胞类型的影响

Google DeepMind于11月11日发布AlphaGenome 2。该模型可预测DNA变化如何影响特定细胞类型及其状态下的基因活性，而早期工具只能在组织层面进行预测。研究人员现在可以针对某种变异，询问它在心肌细胞和肠道免疫细胞中分别会产生什么影响。该公司今天通过AlphaGenome API向非商业研究开放该模型，并为商业项目提供私人预览。

更精细的预测为何重要

人体内的每个细胞都携带相同的DNA，但不同细胞会开启或关闭不同的基因。在皮肤细胞中无害的变异，可能会干扰脑细胞中的某个基因并导致疾病。AlphaGenome 2可以根据细胞身份进行分析，从而发现整体组织模型会遗漏的这类影响。DeepMind基因组学负责人Žiga Avsec表示，这种精细度对药物研发至关重要，因为疗法往往针对特定细胞类型中的蛋白质。

AlphaGenome 2相比前代产品有何改进

AlphaGenome 1采用并行架构，将模型能力分散到多种组织上，因此对细微细胞类型差异的敏感度有限。AlphaGenome 2则将模型重新设计为条件系统，在每一层都以DNA序列和特定细胞条件作为输入。新模型基于来自68种组织的1亿多个单细胞档案训练，识别出的基因表达变化相关变异几乎是AlphaGenome 1的两倍。它还可以预测此前从未见过的细胞状态（例如疫苗激活的免疫细胞）所受的影响，无需重新训练。