AWS heeft OpenFold3-preview beschikbaar gemaakt via Amazon SageMaker JumpStart, de dienst van het bedrijf voor modelimplementatie. OpenFold3 is ontwikkeld door het OpenFold Consortium en het AlQuraishi Lab van Columbia University en voorspelt structuren van eiwitten, DNA, RNA en kleine moleculen, plus de complexen die ze vormen.
Het eindpunt verwerkt voorspellingen die minuten kunnen duren door opdrachten in een wachtrij te plaatsen en de resultaten via Amazon S3 terug te sturen. Volgens AWS kunnen gebruikers het zo instellen dat het tussen opdrachten terugschakelt naar nul, maar voor actieve SageMaker-instances wordt per uur gefactureerd. Het model is een onderzoeksversie; gebruikers hebben een AWS-account en ondersteunde GPU-capaciteit nodig.
Waarom het ertoe doet
Voor onderzoeksteams met AWS-accounts biedt JumpStart een beheerde manier om voorspellingen van biomoleculaire structuren uit te voeren. De kosten voor GPU-instances en de status als onderzoeksversie blijven wel praktische beperkingen.
