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AWS、SageMaker JumpStartでOpenFold3の研究プレビューを提供

AWSユーザーは、オープンソースの構造予測モデルをマネージド型のSageMakerエンドポイントにデプロイできる。ジョブは非同期で処理され、アイドル時にはゼロまでスケールダウンできる。

短信著者: Oossa公開日: 1 分で読める

AWSは、モデルのデプロイサービスであるAmazon SageMaker JumpStartで、OpenFold3のプレビュー版を利用可能にした。OpenFold ConsortiumとColumbia UniversityのAlQuraishi Labが開発したOpenFold3は、タンパク質、DNA、RNA、小分子、およびそれらが形成する複合体の構造を予測する。

このエンドポイントは、処理に数分かかることもある予測ジョブをキューに入れ、結果をAmazon S3経由で返す。AWSによると、ジョブ間のアイドル時にゼロまでスケールダウンするよう設定できるが、稼働中のSageMakerインスタンスには時間単位の料金がかかる。このモデルは研究プレビュー版で、利用にはAWSアカウントと対応するGPU容量が必要だ。

なぜ重要か

AWSアカウントを持つ研究チームは、JumpStartを使って生体分子の構造予測をマネージド環境で実行できる。ただし、GPUインスタンスの料金と研究プレビュー版である点は、利用上の制約として残る。

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